Інтеграція генетичної, транскрипційної та біологічної інформації дає уявлення про ожиріння

Предмети

Анотація

Об’єктивна

Показники розподілу жиру в організмі успадковуються, але мало повідомляється про генетичні сигнали в рамках досліджень асоціацій, що стосуються геномів (GWAS) комп’ютерної томографії (КТ), вимірювання розподілу жиру в організмі. Ми мали на меті виявити гени, пов’язані з ознаками ожиріння, та ключові фактори, що є центральними для регуляторних мереж жирової системи.

біологічної

Предмети

Ми проаналізували дані про експресію транскриптів генів у крові від учасників Framingham Heart Study, великої когорти, заснованої на громаді (n до 4303), а також здійснив інтегративний аналіз цих даних та існуючої біологічної інформації.

Результати

Наша асоціація аналізує виявлені унікальні та загальні ознаки експресії генів за кількома ознаками ожиріння, включаючи індекс маси тіла, співвідношення талії та стегна, обхват талії та показники, виміряні КТ, включаючи обсяг та якість вісцеральних та підшкірних жирових тканин. Ми визначили шість збагачених шляхів KEGG та два модулі співвираження для подальшого дослідження жирових регуляторних мереж. Інтегративний аналіз виявив чотири набори генів (апоптоз, сигнальний шлях p53, протеасома, опосередкований убіквітином протеоліз) та два модулі коекспресії зі значущими генетичними варіантами та 94 ключові драйвери/гени, локальні мережі яких збагачені генами, пов’язаними з ожирінням, припускаючи, що ці збагачені шляхи або модулі мають генетичний вплив на ожиріння. Більшість ідентифікованих ключових генів-драйверів беруть участь у важливих біологічних процесах, таких як контроль клітинного циклу, відновлення ДНК та деградація регуляторних білків пов'язані з раком.

Висновки

Наш інтегративний аналіз генетичної, транскрипційної та біологічної інформації надає список вагомих кандидатів для подальших подальших функціональних досліджень з метою виявлення біологічних механізмів, що лежать в основі ожиріння. Ці кандидати підкреслюють значення вивчення ознак похідного від КТ та центрального ожиріння.