Правила перестановки водню: обчислювальна фрагментація MS/MS та з’ясування структури за допомогою програмного забезпечення MS-FINDER

Історія публікацій

Перегляди статей

Альтметричний

Цитати

Перегляди статей - це сумісна з COUNTER сума повнотекстових завантажень статей з листопада 2008 року (як PDF, так і HTML) для всіх установ та приватних осіб. Ці показники регулярно оновлюються з урахуванням використання до останніх кількох днів.

Цитати - це кількість інших статей, що цитують цю статтю, розрахована Crossref і оновлюється щодня. Знайдіть більше інформації про кількість посилань Crossref.

Альтметричний показник уваги - це кількісний показник уваги, яку дослідницька стаття приділяла Інтернету. Клацнувши на піктограму пампушки, ви завантажите сторінку на altmetric.com із додатковими відомостями про оцінку та присутність у соціальних мережах для даної статті. Знайдіть більше інформації про показник висоти уваги та про те, як обчислюється рахунок.

Анотація

Довідкова інформація

Додаткова інформація доступна безкоштовно на веб-сайті публікацій ACS за адресою DOI: 10.1021/acs.analchem.6b00770.

Рукопис SI: (1) Деталі курації наборів даних MassBank, GNPS та людської плазми, (2) Деталі курації баз даних метаболомів та (3) Деталі порівняння програм (PDF).

Рисунок S1: Структурні фрагментаційні схеми, описані на малюнку 2 (PDF).

Рисунок S2: Результат пікової анотації спектрів MS/MS гуанозин 5’-дифосфоглюкози та передбачувана схема фрагментації (PDF).

Рисунок S3: Результат прогнозування формули з результатом лише оцінки бази даних. х і р осі дають рейтинг та накопичені відсотки від загальної кількості записів. (а) Результат набору перевірки MassBank, коли цільові елементи встановлені на CHNOPS. (b) Результат набору перевірок MassBank, коли цільові елементи встановлені на CHNOPS плюс атоми галогену. (c) Результат набору даних плазми крові людини, отриманий з HILIC-ESI (+) - QTOF MS/MS з масовим допуском 5 мДа. На кожній панелі "випадковий" вказує на випадковий вибір кандидатів як базовий показник. Крім того, “кількість баз даних” вказує на результат, отриманий лише з балів бази даних, який також використовується як базовий показник для пояснення ефекту оцінок метаданих (PDF).

Рисунок S4: Результат вибору структури для сховища PubChem. Дані структури для всіх кандидатів формул були отримані зі сховища PubChem. Набір даних був таким самим, як на малюнку 8. (а) Результат даних MassBank, коли цільові елементи були встановлені на CHNOPS. (b) Результат даних MassBank, коли цільові елементи були встановлені на CHNOPS та галогени. (c) Результат даних про плазму людини, отриманих за допомогою HILIC-ESI (+) - QTOFMS з масовим допуском 5 мДа (PDF).

Таблиця S1: Статистика перестановок водню для елементів CNOPS в GNPS (PDF).

Таблиця S2: Детальні відомості про анотації на малюнку 2 (PDF).

Таблиця S3: Внутрішня база даних формул з 14 баз даних метаболомів (XLSX).

Таблиця S4: Внутрішня структура бази даних з 14 баз даних метаболомів (XLSX).

Таблиця S5: 5063 записи MassBank, використані в цьому дослідженні (XLSX).

Таблиця S6: 936 записів плазми людини, використаних у цьому дослідженні (XLSX).

Таблиця S7: Статистика елементів формули баз даних формул для визначення практичних співвідношень елементів (XLSX).

Таблиця S8: Внутрішній HILIC-ESI (+) - бібліотека QTOFMS метаболітів плазми крові людини (XLSX).